Sajna
Sakłak (dopływ Wiercicy)
Sama
Samica Kierska
San
Sanica
Sanna (dopływ Wisły)
Sapina
Sąpólna
Serafa
Sierpienica
Skawa
Skawica
Skawinka
Skotawa
Skroda (dopływ Nysy Łużyckiej)
Skrwa
Sławka (dopływ Wieprza)
Słomianka
Słupia
Smarkata
Smuga (dopływ Czarnego Potoku)
Sobiepanka
Sobińska Struga
Solinka
Sołokija
Sołotwa
Sopot (dopływ Tanwi)
Stara Rega (rzeka)
Stepnica
Stobnica (dopływ Iny)
Stoła
Stradomka (dopływ Raby)
Strug
Strwiąż
Stryszawka
Strzegomka (dopływ Bystrzycy)
Stuchowska Struga
Studnica (dopływ Wieprzy)
Styna
Symsarna
Szarka (dopływ Obry)
Szczeberka
Szczyra
Szeszupa
Szkarpawa
Szkło (dopływ Sanu)
Szotkówka (dopływ Olzy)
Szreniawa (dopływ Wisły)
Szum